Summary
JavaScriptファイル自体を gzip で圧縮して読み込ませれば良い．
<script type="text/javascript" src="prototype.js.gz"></script>
圧縮されたJavaScriptがSafariで読み込めない問題
圧縮したJavaScriptファイルの拡張子を .jgz とし，
mod_rewriteで .jgz へのアクセスを .js にリダイレクト．
RewriteEngine on
RewriteCond %{HTTP_USER_AGENT} ".*Safari.*" [OR]
RewriteCond %{HTTP:Accept-Encoding} !gzip
RewriteRule (.*)\.jgz$ $1\.js [L]
AddType "text/javascript;charset=UTF-8" .jgz
AddEncoding gzip .jgz
Reference
亜細亜の蛾 - 2006-11-16 - prototype.jsを10KBにする方法
http://asiamoth.com/mt/archives/2006-11/16_2331.php
こぶたのラッパ : 世界の片隅で.jgzと言ってみる
http://smil.exblog.jp/4650470/