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日々のメモ

カテゴリ : Mac

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OS X Yosemite + homebrew + TeX環境

Summary

OS X Yosemite で TeX 環境の構築。

homebrew, brewcask で ghostscirpt, imagemagick, mactex をインストール

$ brew install ghostscript imagemagick
$ brew cask install mactex
$ sudo chown -R USERNAME:admin /usr/local/texlive

mactexをアップデート

$ tlmgr update --self --all
tlmgr: package repository ftp://ftp.u-aizu.ac.jp/pub/tex/CTAN/systems/texlive/tlnet
tlmgr: saving backups to /usr/local/texlive/2014/tlpkg/backups
[1/1, ??:??/??:??] update: texlive.infra [297k] (34227 -> 35898) ... done
Restarting tlmgr to complete update ...
tlmgr: package repository ftp://ftp.kddilabs.jp/CTAN/systems/texlive/tlnet
tlmgr: saving backups to /usr/local/texlive/2014/tlpkg/backups
[  1/534] auto-remove: physymb ... done
[  2/534] auto-remove: ps2pkm.universal-darwin ... done
[  3/534] auto-remove: mh ... done
[  4/534] auto-remove: persian-modern ... done
...
...
...

texmf.cnf を作成

$ mkdir /usr/local/texlive/texmf-local/web2c
$ vi /usr/local/texlive/texmf-local/web2c/texmf.cnf

shell_escape_commands = \
bibtex,bibtex8,bibtexu,upbibtex,biber,\
kpsewhich,\
makeindex,mendex,texindy,\
mpost,upmpost,\
repstopdf,epspdf,extractbb

日本語フォント対応

$ mkdir -p /usr/local/texlive/texmf-local/fonts/opentype/hiragino/
$ cd /usr/local/texlive/texmf-local/fonts/opentype/hiragino/
$ ln -fs "/Library/Fonts/ヒラギノ明朝 Pro W3.otf" ./HiraMinPro-W3.otf
$ ln -fs "/Library/Fonts/ヒラギノ明朝 Pro W6.otf" ./HiraMinPro-W6.otf
$ ln -fs "/Library/Fonts/ヒラギノ丸ゴ Pro W4.otf" ./HiraMaruPro-W4.otf
$ ln -fs "/Library/Fonts/ヒラギノ角ゴ Pro W3.otf" ./HiraKakuPro-W3.otf
$ ln -fs "/Library/Fonts/ヒラギノ角ゴ Pro W6.otf" ./HiraKakuPro-W6.otf
$ ln -fs "/Library/Fonts/ヒラギノ角ゴ Std W8.otf" ./HiraKakuStd-W8.otf
$ mktexlsr
mktexlsr: Updating /usr/local/texlive/2014/texmf-config/ls-R...
mktexlsr: Updating /usr/local/texlive/2014/texmf-dist/ls-R...
mktexlsr: Updating /usr/local/texlive/2014/texmf-var/ls-R...
mktexlsr: Updating /usr/local/texlive/texmf-local/ls-R...
mktexlsr: Done.

ヒラギノをPDFに埋め込み

$ updmap-sys --setoption kanjiEmbed hiragino
updmap will read the following updmap.cfg files (in precedence order):
  /usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg
updmap may write changes to the following updmap.cfg file:
  /usr/local/texlive/2014/texmf-config/web2c/updmap.cfg
Creating new config file /usr/local/texlive/2014/texmf-config/web2c/updmap.cfg
dvips output dir: "/usr/local/texlive/2014/texmf-var/fonts/map/dvips/updmap"
pdftex output dir: "/usr/local/texlive/2014/texmf-var/fonts/map/pdftex/updmap"
dvipdfmx output dir: "/usr/local/texlive/2014/texmf-var/fonts/map/dvipdfmx/updmap"
updmap [WARNING]: font manfnt is defined multiple times:
updmap [WARNING]:   mflogo.map (from /usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg)
updmap [WARNING]:   manfnt.map (from /usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg) (used)

updmap is creating new map files
using the following configuration:
  LW35 font names                  : URWkb (/usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg)
  prefer outlines                  : true (/usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg)
  texhash enabled                  : true
  download standard fonts (dvips)  : true (/usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg)
  download standard fonts (pdftex) : true (/usr/local/texlive/2014/texmf-dist/web2c/updmap.cfg)
  kanjiEmbed replacement string    : hiragino (/usr/local/texlive/2014/texmf-config/web2c/updmap.cfg)
  kanjiVariant replacement string  :  (default)
  create a mapfile for pxdvi       : false (default)

Scanning for LW35 support files  [  3 files]
Scanning for MixedMap entries    [ 44 files]
Scanning for KanjiMap entries    [  6 files]
Scanning for Map entries         [235 files]

Generating output for dvipdfmx...
Generating output for ps2pk...
Generating output for dvips...
Generating output for pdftex...

Files generated:
  /usr/local/texlive/2014/texmf-var/fonts/map/dvips/updmap:
	   15796 2015-02-28 23:18:50 builtin35.map
	   21269 2015-02-28 23:18:50 download35.map
	 1390514 2015-02-28 23:18:50 psfonts_pk.map
	 1651147 2015-02-28 23:18:50 psfonts_t1.map
	 1645321 2015-02-28 23:18:50 ps2pk.map
		  14 2015-02-28 23:18:51 psfonts.map -> psfonts_t1.map
  /usr/local/texlive/2014/texmf-var/fonts/map/pdftex/updmap:
	 1645328 2015-02-28 23:18:51 pdftex_dl14.map
	 1643663 2015-02-28 23:18:50 pdftex_ndl14.map
		  15 2015-02-28 23:18:51 pdftex.map -> pdftex_dl14.map
  /usr/local/texlive/2014/texmf-var/fonts/map/dvipdfmx/updmap:
		6588 2015-02-28 23:18:49 kanjix.map

Transcript written on "/usr/local/texlive/2014/texmf-var/web2c/updmap.log".
updmap: Updating ls-R files.

TexShopの削除とbrewcask から最新版をインストール

$ sudo rm /Applications/TeXShop.app
$ brew cask install texshop

TeXShopの環境設定


Sourceタブ

TeXShop Preferences - Sources
[Set Default Values]から "pTeX (ptex2pdf)" を選択
Encoding で Unicode (UTF-8) を選択

Engineタブ

TeXShop Preferences - Engine
pdfTeX の Tex

pdftex --file-line-error --synctex=1

pdfTeX の Latex

pdflatex --file-line-error --synctex=1

TeX + dvips + distiller の Tex

ptex2pdf -e -ot "-synctex=1 -file-line-error"

TeX + dvips + distiller の Latex

ptex2pdf -l -ot "-synctex=1 -file-line-error"

定期的なアップデート

$ tlmgr update --self --all

Reference

h_uenoharaのブログ - 2014-02-02 - OS X MavericksにTeX環境を構築した記録
http://uenohara.hatenablog.jp/entry/2014/02/02/224140

zsh で homebrew の補完

Summary

zsh で homebrew の補完をしたい。
/usr/local/Library/Contributions/brew_zsh_completion.zsh が補完ファイルなので、
/usr/local/share/zsh/site-functions にシンボリックリンクを設定すれば良い。

以下を実行

$ cd /usr/local/share/zsh/site-functions
$ ln -s ../../../Library/Contributions/brew_zsh_completion.zsh _brew

Reference

よんちゅBlog - 2012-04-15 - zshでHomebrewを使用する場合に設定しておいたほうが良いこと
http://yonchu.hatenablog.com/entry/20120415/1334506855

Mac OS X でキーリピートが効かない場合の原因と対策

Summary

英数字を長押ししてもキーリピートが効かない。
a を長押しすると、ウムラウト付きのaなどが出てくる。

これは "Character Picker" と呼ばれる機能のようだ。
Character Picker を無効にして、キーリピートが効くようにしたい。

ApplePressAndHoldEnabled という値を変更すれば良い。
変更にはrebootが必要とのこと。

Character Pickerを無効にし、キーリピートを有効にする

% defaults write -g ApplePressAndHoldEnabled -bool false

Character Pickerを有効にし、キーリピートを無効にする

% defaults write -g ApplePressAndHoldEnabled -bool true

初期値にする

% defaults delete -g ApplePressAndHoldEnabled

Reference

Appleサポートコミュニティ - 2013-06-25 - 「英数キーの連続押し」による連続入力
https://discussionsjapan.apple.com/message/100775356

Mac Tweaks - Change Key Repeat vs. Character Picker
http://mac.software.com/tweaks/change-key-repeat-vs-character-picker

はがきデザインキット2015の住所録インポートで文字化けする場合の解決方法

Summary

はがきデザインキット2015の住所録はCSVでインポートが可能。
しかし、Mac で 英語優先にしている場合、文字化けが発生。
日本語優先にして再起動すれば文字化けせずにインポートが可能。

CSVの文字コードは Shift_JIS, 改行コードは CR+LF

System Preferences
Language & Region
Preferred languages
Restart

Reference

ゆうびん.jp - はがきデザインキット
https://yu-bin.jp/create/design_kit/

via

うむらうす - 2009-01-04 - 宛名職人 → デザインキット住所録移行の罠
http://www.umurausu.info/blog/archives/001490.html

memorandums - 2013-12-23 - はがきデザインキット
http://memorandums.hatenablog.com/entry/2013/12/23/124605

himazu memo 2.0 - 2013-12-25 - Macで「はがきデザインキット」を使うヒント
http://himazu.blogspot.jp/2013/12/mac.html

Automator の Watermark PDF Workflow が動作しない場合の解決方法

Summary

OS X 10.10 Yosemite にしてから、
Automator の Watermark PDF Workflow が動作しなくなった。

Watermark PDF WorkflowのPythonスクリプトを修正後、
Run Shell Script で実行させることで動作するようになった。

Automator Watermark PDF Workflow Trouble Shooting

patch

% diff -c /System/Library/Automator/Watermark\ PDF\ Documents.action/Contents/Resources/tool.py tool.py > watermark_pdf_yosemite.patch

として作成


patch 適用

% cp /System/Library/Automator/Watermark\ PDF\ Documents.action/Contents/Resources/tool.py ./tool.py
% patch < watermark_pdf_yosemite.patch

Automator の Run Shell Script

Pass input を to stdin から as arguments に変更しておく。

Get Specified Finder Items で指定するWatermarkのファイルのパスは $1 に入る。
Finder から受け取るファイルのパスは $2 に入る。

$HOME/path/to/tool.py \
--over \
--xOffset 480 \
--yOffset 660 \
--angle 0 \
--scale 0.12 \
--opacity 1.0 \
--input "$2" \
--output "${2%.*} (Watermark).${2##*.}" \
"$1"

Reference

Automator Watermark PDF Workflow | Apple Support Communities
https://discussions.apple.com/thread/6620337

OS X Yosemite のブータブルUSBを作成する

Summary

OS X YosemiteのブータブルUSBを作成する。
OS X Yosemiteをダウンロード後、以下を実行。
USB_NAMEは任意の名前に読み替えること。

% sudo /Applications/Install\ OS\ X\ Yosemite.app/Contents/Resources/createinstallmedia --volume /Volumes/USB_NAME --applicationpath /Applications/Install\ OS\ X\ Yosemite.app --nointeraction

Erasing Disk: 0%... 10%... 20%... 30%...100%...
Copying installer files to disk...
Copy complete.
Making disk bootable...
Copying boot files...
Copy complete.
Done.

Reference

How to Make an OS X Yosemite Boot Installer USB Drive
http://osxdaily.com/2014/10/16/make-os-x-yosemite-boot-install-drive/

via

OS X Yosemite のブータブルUSBドライブを作り、クリーンインストールする方法 – オーケーマック
http://okaymac.com/2014/10/17/how-to-create-os-x-yosemite-bootable-usb/

brew cask の upgrade

Summary

brew cask でインストールしたアプリケーションは、
brew upgrade 等でアップグレードできない。

brew cask upgrade を実現するワンライナー

for c in `brew cask list`; do ! brew cask info $c | grep -qF "Not installed" || brew cask install $c; done

brew cask upgrade できるパッケージを表示するワンライナー

for c in `brew cask list`; do ! brew cask info $c | grep -qF "Not installed" || echo $c "can upgrade."; done

Reference

Qiita - homebrew-cask - brew caskのappどもをupgradeする
http://qiita.com/2k0ri/items/9fe8d33a72dbfb15fe6b

brew cask upgrade > Issue #309 > caskroom/homebrew-cask
https://github.com/caskroom/homebrew-cask/issues/309

プレビューでPDFが文字化けする

Summary

Mac標準の Preview.app でPDFファイルを開き、
ブックマークやマーカーを引いた後、
PDFファイルを上書き保存すると、全文検索ができなくなる。

ブックマーク部分、マーカー部分も文字化け。

保存前は全文検索が可能
保存後は文字化けしてしまう

フォントキャッシュを再構築

$ sudo atsutil databases -remove
Password:
Removing: /private/var/folders/zz/zyxvpxvq6csfxvn_n00000c4000031/C/System
Removing: /private/var/folders/_1/m4rcyx_14y96xbr89wcbsspm0000gn/C/com.apple.FontRegistry
$ atsutil server -shutdown
ATSServer shutdown
$ atsutil server -ping
ATSServer is running

改善せず…。

Reference

プレビューでPDFが文字化けする,の,解法 - 後悔^H^H公開日記:別館
http://d.hatena.ne.jp/monamour555/20090418/1240069900

Homebrew Cask - Homebrewの拡張版

Summary

Homebrew CaskはHomebrewの仕組みを利用したパッケージ管理ツール。

Install

brew tap phinze/homebrew-cask
brew install brew-cask

パッケージの検索 (textmate)

brew cask search textmate
==> Exact match
textmate

パッケージのInstall (textmate)

brew cask install textmate
==> Downloading http://api.textmate.org/downloads/release
######################################################################## 100.0%
==> Symlinking App 'TextMate.app' to '/Users/yoshiki/Applications/TextMate.app'
🍺  textmate installed to '/opt/homebrew-cask/Caskroom/textmate/latest' (340 files, 31M)

アプリケーションのインストール先, Caskroom のパスを変更

export HOMEBREW_CASK_OPTS="--appdir=/Applications --caskroom=/usr/local/Caskroom"


CaskroomをAlfredの検索パスに追加

homebrew-caskで入れたアプリはシンボリックリンクになる。
そのままでは、ランチャーソフトウェア alfred の検索対象外になるが、
brew cask alfred コマンドで, alfred の検索対象にしてくれる。

$ brew cask alfred link

Reference

Homebrew Cask
http://caskroom.io/

phinze/homebrew-cask
https://github.com/phinze/homebrew-cask

yo_waka's blog - 2014-01-19 - Macの環境構築にhomebrew-cask+Brewfile便利
https://waka.github.io/2014/1/19/homebrew_cask.html

Mac で MML の制作環境を整える

Summary

Mac OS X Mavericksで Magical 8bit Plug[2014-03-09-1] を認識しないので、
MMLでチップチューンを作成する環境を整えることにする。

ppmck をインストールするよりも、 vim-mml を入れるほうが断然楽。

vim-mml のインストール

.vimrc

NeoBundle 'stephencelis/vim-mml'
autocmd FileType mml nnoremap <Leader>m :MmlMake<CR>

:NeoBundleInstall

Nestopia
Audio Overload をインストールしておくと、
:w :MmlMake で自動的に再生してくれる。


------------------------------

ppmck をインストール

ppmck をダウンロード

ppmck09a.zip を解凍

% unzip ppmck09a.zip

mck/src/compile_unix.sh の編集

nkf の -e オプションを -w オプションに変更

if which nkf > /dev/null; then
	nkf --overwrite -w -Lu *.c *.h
else

コンパイル

% cd mck/src
% sh ./compile_unix.sh

MMLからnsfファイルの作成

% cd mck/songs
% sh ./mknfs sample_auto_bank
MML to MCK Data Converter Ver 0.27 by Manbow-J
pmck modification by BKC rel 0.2
patches FDS enable patch([OK]), 4-46, 4-356, 5-17, 5-95, 5-313, 5-658
ppmck release 9 by h7
sample_auto_bank.mml -> sample_auto_bank.h

-------+---------------+---------------+
Track  |     Total     |     Loop      |
 Symbol|(count)|(frame)|(count)|(frame)|
-------+-------+-------+-------+-------+
   A   | 192000   120000|               |
   B   | 192006   120004|               |
   C   |               |               |
   D   |               |               |
   E   |               |               |
-------+-------+-------+-------+-------+

終了しました

NES Assembler (v2.51)

pass 1
pass 2
segment usage:

	  ZP    $0000-$001A  [  27]
	 BSS    $0200-$02C9  [ 202]
									USED/FREE
BANK   0                            2369/5823
BANK   1                            8180/  12
BANK   2                            8180/  12
BANK   3                            8180/  12
BANK   4                            8178/  14
BANK   5                            8180/  12
BANK   6                            8180/  12
BANK   7                            8180/  12
BANK   8                            6816/1376
									---- ----
									  65K   7K

nsfファイルの再生

VLC で再生可能

% /Applications/VLC.app/Contents/MacOS/VLC sample_auto_bank.nsf &

Reference

github - stephencelis/vim-mml
https://github.com/stephencelis/vim-mml

Software: Nestopia
http://bannister.org/software/nestopia.htm

Software: Audio Overload
http://bannister.org/software/ao.htm

ppmck
http://ppmck.web.fc2.com/ppmck.html

VLC: オフィシャルサイト
https://www.videolan.org/

Macのログインシェルを変更する

Summary

ログインシェルを homebrew の zsh にしていたつもりだったが、
ZSH_VERSION=5.0.2 となっていて、Macに最初から入っているzshを使っているようだった。

/etc/shells に /usr/local/bin/zsh を追加

# List of acceptable shells for chpass(1).
# Ftpd will not allow users to connect who are not using
# one of these shells.

/bin/bash
/bin/csh
/bin/ksh
/bin/sh
/bin/tcsh
/bin/zsh
/usr/local/bin/zsh

chpassを実行

% chpass -s /usr/local/bin/zsh
Changing shell for username.
Password for username:

Reference

Macとかの雑記帳 - 2011-12-30 - MacのログインシェルをHomebrew等で入れたzshやbashに変更する方法
http://tukaikta.blog135.fc2.com/blog-entry-195.html

デフォルトの保存先を iCloud ではなく、ローカルに変更したい

Summary

Mountain Lion以降のiCloud対応アプリで
ファイルを保存しようとすると、保存先がiCloudになる。

毎回変更するのが面倒くさいので、デフォルトの保存先をローカルに変更したい。

デフォルトの保存先をローカルにする

defaults write NSGlobalDomain NSDocumentSaveNewDocumentsToCloud -bool false 
killall Dock

デフォルトの保存先をiCloudにする

defaults write NSGlobalDomain NSDocumentSaveNewDocumentsToCloud -bool true 
killall Dock

Reference

Change the default save location from iCloud to On My Mac - Mac OS X Hints
http://hints.macworld.com/article.php?story=20120820003211714

ファイルの保存場所のデフォルトをiCloudではなくする方法 - Macの手書き説明書
http://veadardiary.blog29.fc2.com/blog-entry-4080.html

VMWare Fusion の仮想マシン上の Windows で Apple USB Super Drive を使う

Summary

VMWare Fusion 5.0.4 の仮想マシン上のWindows8.1で
Apple USB Super Drive を使おうとすると、
以下のエラーメッセージが表示される。

The

The "Apple MacBook Air SuperDrive" device requires installation of the
Apple Boot Camp driver disc in the virtual machine.

対策

Boot Camp Support Software 内の以下ファイルを
仮想マシン上のWindowsにインストールする。

/BootCamp/Drivers/Apple/AppleODDInstaller64.exe

Reference

Apple - Support - Downloads - Boot Camp Support Software
http://support.apple.com/downloads/#boot%20camp%20support%20software

USB Superdrive compatibility? | VMware Communities
https://communities.vmware.com/thread/463971

Vellum - Mac OS X用電子書籍オーサリングアプリケーション

Summary

Vellum は Wordファイルをドラッグ&ドロップすると、
電子書籍ファイルにレイアウト変換してくれるソフトウェア。

ePub, MOBI, iBook形式に対応。

ソフトウェア自体は無料で、ファイル変換する際に課金されるモデル。
1冊 $49.99, 3冊 $99.99, 5冊 $149.99 と、非常にリーズナブル。

Reference

Vellum | 180g
http://180g.co/vellum/

via

hon.jp DayWatch - 2013-12-12 - 元Pixarエンジニアたちのベンチャー180g社、Mac OS X用電子書籍オーサリングアプリ「Vellum」を公開
http://hon.jp/news/1.0/0/5058/

OS Xの通知センターをオフにする

Summary

会議やプレゼンなどで通知センターを一時的にオフにしたい。

通知センターのオン/オフを切り替える

Option を押しながら、メニューバー右端の通知センターアイコンをクリック

通知センターをオフにする

launchctl unload -w /System/Library/LaunchAgents/com.apple.notificationcenterui.plist

通知センターをオンにする

launchctl load -w /System/Library/LaunchAgents/com.apple.notificationcenterui.plist

Reference

Mac Fan.jp - 2013-01-24 - 通知センターをオフにしたい
http://macfan.jp/guide/2013/01/24/mt_2.html

Mac Fan.jp - 2012-08-07 - 通知センターを一時的に切りたい
http://macfan.jp/guide/2012/08/07/post_881.html

terminal-notifier - Mac OS X の通知センターに任意のメッセージを表示する

Install

brew install terminal-notifier

Usage

terminal-notifier -message [MESSAGE] [-title TITLE] [-subtitle SUBTITLE] [-sound SOUNDNAME]

Example

sound は [System Preferences] - [Sound] - [Sound Effects] の中から選択する。
大文字と小文字を区別するので注意。

terminal-notifier -message TEST -title TITLE -subtitle SUBTITLE -sound Submarine

Reference

GitHub - alloy/terminal-notifier
https://github.com/alloy/terminal-notifier

via

Apple情報局 - 2013-05-07 - OS Xの標準機能でここまでできる!ファイルの内容の変更を検知して通知センターに通知するデーモンを簡単に作成する方法
http://ottan.me/2013/05/07/daemon-to-notify-notification-center-by-detecting-file-changes/

109キーボードをMacで使う

Summary

臨時で109キーボードをMacで使うための設定が必要になった。
英語キーボードのように扱うための設定を行った。

System Preferences - Keyboard - [Modifier Keys...]

Command -> Option
Option -> Command

PCKeyboardHack (Seil)

Change Caps Lock 61 Option_R

Enable NFER key on PC keyboard 102
Enable XFER key on PC keyboard 104
Enable KATAKANA key on PC keyboard 104

KeyRemap4Macbook (Karabiner)

Use EISUU as KANA/EISUU (toggle)
Use KANA as KANA/EISUU (toggle)

Reference

Karabiner - OS X用のソフトウェア
https://pqrs.org/osx/karabiner/

Seil - OS X用のソフトウェア
https://pqrs.org/osx/karabiner/seil.html.ja

coreaudiod のログ出力抑制

Summary

警告音 (alert sound)が鳴るたびに coreaudiod からログが出力される。

2013/08/29 11:08:25.048 coreaudiod[120]: Enabled automatic stack shots because audio IO is inactive
2013/08/29 11:08:37.206 coreaudiod[120]: Disabled automatic stack shots because audio IO is active

解決法

/Library/Preferences/Audio/com.apple.audio.ServerSettings.plist を作成
再起動をしなくてもログ出力は抑制できた。

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE plist PUBLIC "-//Apple//DTD PLIST 1.0//EN" "http://www.apple.com/DTDs/PropertyList-1.0.dtd">
<plist version="1.0">
<dict>
	<key>AllowStackShotsDuringIO</key>
	<true/>
</dict>
</plist>


Reference

10.8.4 Update available. What does/doesn't work?
http://www.tonymacx86.com/hp-probook/100563-10-8-4-update-available-what-does-doesnt-work-6.html#post615947

homebrew で R言語

Summary

MacでR言語を利用したい。
gfortran, XQuartzがインストールされていないとビルドできない旨のエラーメッセージが表示される。

XQuartz がインストールされていない場合

% brew install R
Unsatisfied dependency: XQuartz
Homebrew does not package XQuartz. Installers may be found at:
  https://xquartz.macosforge.org
Error: An unsatisfied requirement failed this build.

XQuartzのインストール

XQuartz からダウンロードしてインストール。

gfortranがインストールされていない場合

% brew install R
Error: This formula requires a fortran compiler, but we could not find one by
looking at the FC environment variable or searching your PATH for `gfortran`.
Please take one of the following actions:

  - Decide to use the build of gfortran 4.2.x provided by Homebrew using
        `brew install gfortran`

  - Choose another Fortran compiler by setting the FC environment variable:
        export FC=/path/to/some/fortran/compiler
    Using an alternative compiler may produce more efficient code, but we will
    not be able to provide support for build errors.

gfortran のインストール

% brew install gfortran

R のインストール

% brew install R

2014-02-06 追記

いつの間にか homebrew-science に移動したみたい

% brew tap homebrew/science

Reference

XQuartz
http://xquartz.macosforge.org/

GitHub - Homebrew/homebrew-science
https://github.com/Homebrew/homebrew-science

VMWare Fusion の vmware-vmx が CPU使用率100%を超える問題と解決

Summary

VMWare Fusion の プロセス vmware-vmx が、時々 CPU使用率100%を超えてしまう。

解決方法

仮想マシンファイルの中の vmx ファイルに以下を追記する。

isolation.tools.hgfs.notify.enable = "FALSE"

Reference

VMware KB: Mac OS X dock process uses 100% CPU when Fusion is running
http://kb.vmware.com/selfservice/microsites/search.do?language=en_US&cmd=displayKC&externalId=2011360

OSX Lion上でVMWare Fusionを使うとCPUが100%になる件 - tanamonの日記
http://d.hatena.ne.jp/tanamon/20120201/1328080900